在建州女真，海西女真以北，还居住着一支更为庞大的女真族群野人女真。

野人女真各个部落下又分为小部和各路，尽管孟古得去世令努尔哈赤极为悲痛，但他丝毫没有停下征伐异己的脚步，统一女真的步伐。

努尔哈赤在一步步蚕食海西女真的同时，频频向野人女真用兵，在迁都赫图阿拉此后的近十年间里，野人女真的各个部落在建州女真铁骑持续不断的攻势和努尔哈赤征抚并用的策略下，一一降服。

努尔哈赤征服野人女真的举动引起了海西女真的乌拉部的强烈不满，双方发生激战，三千建州兵以视死如归的气概，和迅雷不及掩耳的攻势，击败了一万的乌拉兵。

大战过后，努尔哈赤没有乘胜追击，虽然乌拉是他要统一女真的一大障碍，但是努尔哈赤并没有急于一时，还需要等待更好的时机。

对于征服乌拉，叶赫这样的大国，努尔哈赤有一个伐树理论，他说大木岂能骤折，毕以斧斤伐之，渐至微细然后能折，相当之国欲一举取之，岂能尽灭乎，且将所属城郭尽消平之，独存其都城，如此则无仆何以为主，无民何以为君?

经过近三十年的杀伐征战之后，努尔哈赤终于百炼成钢，他可以冷静的面对任何艰难的挑战，也能够在巨大利害压迫下寂然不动，等待时机的来临，再以雷霆般的动作一举摧垮敌人，努尔哈赤已经成为俯视群雄的女真之王。

1606年12月，一个雪后初霁的日子，蒙古部落的使臣来到赫图阿拉拜见努尔哈赤，他们向努尔哈赤进献了骆驼马匹等，并尊称努尔哈赤为昆都仑汗，昆都仑是恭敬的意思，因此努尔哈赤也被称为恭敬汗。

这是努尔哈赤第一次被尊称为汗，为他日后建立金国称汗，做了舆论上的准备和铺垫。

哈达灭亡之后，辉发部已经是三面被建州包围，辉发部地理位置上夹在建州和叶赫之间，夺取辉发一方面等于去掉叶赫的一个臂膀，另一方面，可以打开去乌拉的通道。

于是辉发成为了叶赫，乌拉和努尔哈赤三方明争暗夺的对象。

1607年9月，恭敬汗亲自领兵向辉发山城进攻，辉发城在辉发山之上，形势险峻，易守难攻，史书记载，在这一次战斗中，努尔哈赤在攻城之前早已向城中派出内应，这是他非常愿意使用的一招，先后有上百精兵扮作商人混入城中。

攻城之际，内应者作乱开门，迎兵驱入，城中大乱，以至于失守，建州军攻破辉发城，辉发部灭亡。

努尔哈赤有一个胞弟舒尔哈齐，努尔哈赤在赫图阿拉称汗后，舒尔哈齐晋封贝勒，地位仅次于他的兄长，成为第二号人物。

然而1607年他图谋另立门户，与兄长分庭抗礼。

于是舒尔哈齐带着几个儿子和少数部下来到了铁岭东南的黑扯木，在那里伐木建造房屋，开辟新的根据地。而黑扯木临近明朝的军事重镇铁岭，可以直接依靠明朝的军事保护，在他的东面又与乌拉部落接邻，因为他娶了乌拉部贝勒的妹妹，自己的女儿还是乌拉部贝勒的妻子，所以能随时得到盟友的援助。

可是舒尔哈齐根本不是努尔哈赤的对手，他的两个儿子接连被努尔哈赤诛杀，部将也被处死，努尔哈赤余怒未消，仍打算将他的次子阿敏处死，只是在皇太极等人的极力求情下，阿敏才逃过一劫，免于一死，不过他的一半家产被没收。

舒尔哈齐失去了继续抗争的勇气。他知道自己的实力远远不如兄长，而且他所指望的靠山，驻扎在辽东的明军，也处在岌岌可危的境地，根本不是努尔哈赤的对手。在万念俱灰的绝望处境下，舒尔哈齐回到了兄长的帐下。

他被囚禁在一间暗室之中，用铁锁锁住，仅有两个孔穴给他送食物。

1611年舒尔哈齐在囚禁中死去。