他们和家主将领一荣皆荣，一损俱损，在战场上，一般将领舍不得让他们上战场，但是只要上了，这些人都是决对的作战主力。

家丁盛行近百年，已成顽疾，到了如今每次总兵、副将们移镇，都会带着家丁亲信一起上任，利用这些亲信统辖普通的营兵，这也使得他们对主将的依附性越来越强，也因为他们的存在，将领们对营兵越来越扣克，经常干出一些损公肥私的事，成为大明军中一大顽疾。

侍卫亲军是朱由渠一手培养出来的，管控很严，绝不容许军中再出现家丁这些军将私兵，杜绝烂赏乱罚、吃空饷、冒领兵额等一切军中陋习。

同时朱由渠也根据前世的经验，再结合这世将领拥兵自重的现状，对军队的基础结构进行改组，主将的权力受到限制和分散。只保留了操训和领兵作战的权力，执法权，军官任免权和饷权都被剥离了出去，分给了督军和镇抚。大大弱化了主将的权威。

主将掌管作战操训大事，临阵杀伐决断，便于军令畅通。平时督军执掌军法奖惩，记录军功，掌握下级的用人推荐权，是对主将明面的监督。

镇抚掌钱粮和宣传教化，与士卒打成一片，掌握军队的人心，暗地对主将和督军进行监督。督军和镇抚都由上级集体任命，同级主将有推荐权。军官升迁互调利于军官的竞争培养，加强了对军官的驾驭，使其不能抱成一团，仗势横行。

战时讲究的是临机而断，不能扯皮，商议来商议去，战机稍纵即逝，主将杀伐决断集与一身，督军和镇抚都需服从执行，如此众心才能如一。平日权力分散，督军、镇抚各依权责而行，三人互相牵制，各成体系。如此，兵变之事将再难发生！

水师的编制和陆师的编制总体区别较大。

根据不同载重的战船，需要布置不同的兵种和兵力，水师战兵着轻便的锁甲或皮甲，非战斗人员则以鸳鸯战袄作为作战军服。

长江水师的暂定编制如下：

以200料作为最小的战船。每艘额定战兵15人，其中肉搏队6人，统一装备腰刀、藤牌；火枪队6人，配备鸟铳和腰刀，和一定数量的弓、弩；因为船上作战摇晃，弓、弩有时比火枪效率高。炮手3人，负责操作1门虎蹲炮，再加上舵工、瞭望手、开船的水手等辅助人员，共计25人，包含正副船长、船长职同总旗、船副值同小旗。

300料，400料，500料直到千料大船。战兵和水手、炮手的数量逐步对应增加。船长的品级也相对应提升，500到800料的船长值同把总、千料以上的船长值同千总。总兵、参将等独立领军，统领船队。

其中500料大战船，至少要装备大小弗朗机炮6门，虎蹲炮10门。

千料战船，至少要装备大小红夷炮12门，如果真的装备齐了，火力还是很强大的。非常适合用来海战，内河水战的话，反倒笨拙，用500料以下的战船足矣，以300和400料的作为主力战船。每船配备二十多个肉搏和火枪兵及十几个炮手。操作3到4门弗朗机炮。

内河战船适宜多配佛朗机，因为交战距离短，佛朗机后装炮因为漏气导致射程短，威力小的劣势不明显。而比前装红夷炮装填炮弹简便，连续射速更快。扬长避短。到了海上，就是红夷炮的天下了。

经过两个多月的筹集，长江水师共有千料以上大船4艘、800料战船10艘、500料战船23艘，400料战船32艘、300料战船48艘，200料战船105艘，大小主力战船合计约230艘（大半是海贼王郑芝龙提供的），另有200料以下的舢板、叶子舟、鸟船等无算。能够同时容纳战兵和水手合计一万余人。足以装下所有新近招募的水勇了。

亲军水陆军卒，根据能力不同，共分三级，从低到高分别为准卒、正卒、锐卒。每级别军士的月俸和月粮待遇不等。

准卒的要求是十五岁以上，五十五以下，身体未有残疾的男性。无阿芙蓉膏吸食史，准卒月俸银一两，月粮三斗。正式成军前的亲军新兵暂时就是这个待遇。

正卒的要求是二十以上，五十以下，身体未有残疾，且粗通武艺（刀枪棍棒，拳法格斗）或技艺（会施放火炮，会骑马，会射箭，会放铳等等）中一种或者多种，熟悉战阵；有野战经验的的优先。无阿芙蓉膏吸食史，正卒月俸银一两五钱，月粮八斗。正式成军后的亲军就是这待遇。

锐卒的要求是二十以上，四十五以下，身体未有残疾的男性，精通武艺或技艺的一种或多种，根据戚继光九等技艺标准，必须达到四等以上，考核合格；熟悉战阵；有十次以上野战经验，实战经验丰富；有阵斩建奴首级者优先晋级锐卒。无阿芙蓉膏吸食史。锐卒月俸银二两，月粮一石二斗。正式成军后的炮兵、海员、斥候等少数技术兵种享受的是锐卒的待遇。

为了提高他们的当兵积极性，朱由渠君臣也算是煞费苦心了。