神域文明军队又按军团、师、旅、团、连的划分。神域的最高指挥中心是军事国防部，国防部长，一般由军中资历最优秀的星际元帅担任，但必须获得神帝的认可，才能担任这个职位。“神帝”对国防部有直接任免权。

国防部部长之下，是各作战军团的军团司令，其次，按各军种划分，可分为星际舰队舰队司令、机动战士军团司令、空军司令、陆军司令、海军司令。

而在星际作战的未来作战背景之下，星际舰队、太空战机、太空机动战士军团联合作战，显得尤其重要，而陆军和海军则是争夺星球控制权的重要主力军队。当星际舰队，在取得太空战的制空权后，空军可以去对争夺星球战场进行空中打击支持、对登陆作战部队进行火力掩护。

贵族阶层及特殊组织：

贵族联盟，是神域文明中最独特的宇宙性组织，它代表着广大各界优秀精英阶层、功勋元老世家，其中不乏至高议会中两大议会的代表，都是贵族联盟的成员。

按公爵、侯爵、伯爵、子爵、男爵等级爵位来划分其组织成员地位。而如果要想获得贵族联盟的爵位就必须不断完成贵族联盟所颁布的任务。通过考验和任务，来证明你的人品和才能，你才能是算是贵族联盟的当中成员。

贸易联盟，是一个宇宙性商业权威的组织，这个组织也是在神域文明中所创立起来，由几位富可敌国的大商业家所组成的联盟行会组织，吸引了神域宇宙各大同盟文明的众多优秀商业公司机构的加盟。只要你加入贸易联盟，成为他们的一员，他们就能给你提供优秀商业精英人才信息、商业各领域的支持、优秀商业精英团队的培养等优厚的条件，而你的公司，在各个殖民星球中迅速崛起。

而加入贸易联盟后，你就必须无偿的定期支付一笔加盟费用。而贸易联盟加盟标准，一是有一定的经济实力和发展潜力的公司，二是具备诚信经营的公司，三是具备一定人脉和行业影响力的公司。

而贸易联盟的成功运作，离不开神域文明政府的支持，因此，贸易联盟每年都会定期，无偿给予政府一笔支持联盟在各个星球上商业运行的费用，用于帮助政府用来基础建设和公共服务建设。

英雄战斗联盟，是一个战斗英雄荣誉组织，每一个加入英雄者联盟的，都必须是战场上英雄，是国民所拥戴和尊敬的心目中英雄。因此，英雄者联盟，在神域拥有着比神帝还高的影响力。而英雄荣誉也划分为：一级、二级、三级这三个等级荣誉，一级英雄可以受到神帝的亲自接见，配发荣誉一级战斗英雄勋章，并获得一笔巨额奖金和御赐首都别墅一套。二级英雄则可以为发行国债进行宣传，成为国民心中的英雄，三级英雄，可获得一笔转业安置优待政策和成为战斗英雄奖金。

而一旦达到三级英雄标准，就可以加入“英雄者联盟”，并有机会获得联盟内部任务委托，当一定任务荣誉累积起来时，可以获得联盟认可，获得二级英雄的荣誉。相比贵族联盟的有点爵位相比，这英雄者联盟奖励要靠谱的多，因为这是一个政府和军事国防部所创立的特殊组织。

其次，剩下的都是一些民间组织：科学研究学会、星际矿业开采联合行会、自动化生产行会、生态农业行会、艺术行业公会、娱乐文化发展行会、志愿者服务公会、工人技术公会、机器人行会、生物制药基因研究星际联合集团公司、克隆人组织的公会、公共医疗卫士服务公会、星际物流采购联合会、外星文明联盟行会……等民间组织和机构、企业公司。